Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCM2Q9BSQ5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms