Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C2orf88Q9BSF0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms