Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIOK1Q9BRS2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RIOK1Q9BRS2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms