Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR3

TMEM246, Transmembrane protein 246, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM246Q9BRR3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM246Q9BRR3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms