Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBA1CQ9BQE3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA1CQ9BQE3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms