Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms