Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRT1Q99946 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms