Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSG101Q99816 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSG101Q99816 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms