Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOTCH4Q99466 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NOTCH4Q99466 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NOTCH4Q99466 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NOTCH4Q99466 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
NOTCH4Q99466 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOTCH4Q99466 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOTCH4Q99466 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOTCH4Q99466 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOTCH4Q99466 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOTCH4Q99466 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOTCH4Q99466 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOTCH4Q99466 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOTCH4Q99466 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms