Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAP1L3Q99457 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms