Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DEPDC7Q96QD5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEPDC7Q96QD5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms