Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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