Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC85AQ96PX6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC85AQ96PX6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms