Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SAMD11Q96NU1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMD11Q96NU1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms