Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RUNDC3BQ96NL0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms