Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF396Q96N95 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF396Q96N95 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF396Q96N95 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF396Q96N95 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF396Q96N95 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF396Q96N95 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF396Q96N95 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF396Q96N95 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF396Q96N95 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF396Q96N95 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF396Q96N95 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF396Q96N95 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF396Q96N95 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF396Q96N95 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF396Q96N95 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF396Q96N95 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF396Q96N95 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF396Q96N95 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF396Q96N95 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF396Q96N95 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF396Q96N95 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF396Q96N95 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF396Q96N95 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms