Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF488Q96MN9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF488Q96MN9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms