Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM20AQ96MK3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM20AQ96MK3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms