Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC138Q96M89 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC138Q96M89 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms