Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPZA3Q96KX2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPZA3Q96KX2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPZA3Q96KX2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms