Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDLIM2Q96JY6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDLIM2Q96JY6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDLIM2Q96JY6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms