Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCPIP1Q96JH7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCPIP1Q96JH7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VCPIP1Q96JH7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCPIP1Q96JH7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCPIP1Q96JH7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCPIP1Q96JH7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VCPIP1Q96JH7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCPIP1Q96JH7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VCPIP1Q96JH7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VCPIP1Q96JH7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCPIP1Q96JH7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VCPIP1Q96JH7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VCPIP1Q96JH7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VCPIP1Q96JH7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VCPIP1Q96JH7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VCPIP1Q96JH7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VCPIP1Q96JH7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VCPIP1Q96JH7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms