Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK5RAP3Q96JB5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK5RAP3Q96JB5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms