Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SHDQ96IW2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms