Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPNQ96H22 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPNQ96H22 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPNQ96H22 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CENPNQ96H22 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPNQ96H22 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPNQ96H22 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPNQ96H22 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPNQ96H22 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPNQ96H22 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPNQ96H22 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPNQ96H22 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CENPNQ96H22 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPNQ96H22 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CENPNQ96H22 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPNQ96H22 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPNQ96H22 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPNQ96H22 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPNQ96H22 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPNQ96H22 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPNQ96H22 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPNQ96H22 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPNQ96H22 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPNQ96H22 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPNQ96H22 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPNQ96H22 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPNQ96H22 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPNQ96H22 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPNQ96H22 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPNQ96H22 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPNQ96H22 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPNQ96H22 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPNQ96H22 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPNQ96H22 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPNQ96H22 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPNQ96H22 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPNQ96H22 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPNQ96H22 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPNQ96H22 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPNQ96H22 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPNQ96H22 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPNQ96H22 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPNQ96H22 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPNQ96H22 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPNQ96H22 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPNQ96H22 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPNQ96H22 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPNQ96H22 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPNQ96H22 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPNQ96H22 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPNQ96H22 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPNQ96H22 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPNQ96H22 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPNQ96H22 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms