Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RRP36Q96EU6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP36Q96EU6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP36Q96EU6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms