Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms