Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RMDN1Q96DB5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RMDN1Q96DB5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms