Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCTD12Q96CX2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCTD12Q96CX2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms