Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBGCP3Q96CW5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms