Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
OPTNQ96CV9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
OPTNQ96CV9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms