Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLCD1Q96CP7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLCD1Q96CP7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms