Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms