Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM43Q96BQ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM43Q96BQ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
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