Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VOPP1Q96AW1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms