Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTP4Q969X6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTP4Q969X6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.1 ms