Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2E3Q969T4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2E3Q969T4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2E3Q969T4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2E3Q969T4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2E3Q969T4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2E3Q969T4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2E3Q969T4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2E3Q969T4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2E3Q969T4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2E3Q969T4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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UBE2E3Q969T4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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UBE2E3Q969T4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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UBE2E3Q969T4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE2E3Q969T4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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UBE2E3Q969T4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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UBE2E3Q969T4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE2E3Q969T4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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UBE2E3Q969T4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2E3Q969T4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2E3Q969T4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2E3Q969T4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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UBE2E3Q969T4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2E3Q969T4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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UBE2E3Q969T4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2E3Q969T4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE2E3Q969T4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE2E3Q969T4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE2E3Q969T4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE2E3Q969T4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE2E3Q969T4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE2E3Q969T4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2E3Q969T4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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