Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP13Q92995 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP13Q92995 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP13Q92995 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP13Q92995 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP13Q92995 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP13Q92995 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP13Q92995 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP13Q92995 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP13Q92995 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP13Q92995 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP13Q92995 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP13Q92995 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP13Q92995 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP13Q92995 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP13Q92995 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP13Q92995 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP13Q92995 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP13Q92995 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP13Q92995 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP13Q92995 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP13Q92995 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP13Q92995 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP13Q92995 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP13Q92995 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP13Q92995 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP13Q92995 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP13Q92995 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP13Q92995 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP13Q92995 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP13Q92995 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP13Q92995 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP13Q92995 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP13Q92995 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP13Q92995 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP13Q92995 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP13Q92995 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP13Q92995 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP13Q92995 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP13Q92995 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP13Q92995 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP13Q92995 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP13Q92995 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP13Q92995 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP13Q92995 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP13Q92995 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP13Q92995 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP13Q92995 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP13Q92995 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP13Q92995 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP13Q92995 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP13Q92995 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP13Q92995 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP13Q92995 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP13Q92995 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP13Q92995 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP13Q92995 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP13Q92995 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP13Q92995 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP13Q92995 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP13Q92995 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP13Q92995 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP13Q92995 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP13Q92995 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP13Q92995 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP13Q92995 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP13Q92995 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP13Q92995 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP13Q92995 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP13Q92995 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP13Q92995 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP13Q92995 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP13Q92995 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP13Q92995 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP13Q92995 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP13Q92995 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP13Q92995 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP13Q92995 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP13Q92995 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP13Q92995 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP13Q92995 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP13Q92995 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP13Q92995 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP13Q92995 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
USP13Q92995 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP13Q92995 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP13Q92995 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP13Q92995 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP13Q92995 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP13Q92995 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP13Q92995 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP13Q92995 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP13Q92995 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP13Q92995 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USP13Q92995 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP13Q92995 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP13Q92995 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP13Q92995 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP13Q92995 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP13Q92995 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms