Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLP1Q92989 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLP1Q92989 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLP1Q92989 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLP1Q92989 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLP1Q92989 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLP1Q92989 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLP1Q92989 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLP1Q92989 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLP1Q92989 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLP1Q92989 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLP1Q92989 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLP1Q92989 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLP1Q92989 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLP1Q92989 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLP1Q92989 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLP1Q92989 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLP1Q92989 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLP1Q92989 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CLP1Q92989 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLP1Q92989 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLP1Q92989 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms