Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC4Q92889 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC4Q92889 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms