Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms