Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL2Q92772 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms