Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABGGTAQ92696 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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