Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERVK_113Q902F9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms