Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCG3Q8WXD2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG3Q8WXD2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms