Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTRT1Q8TDG2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms