Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGR3Q8TD06 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms