Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms