Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR4

STAG3L4, Putative STAG3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L4Q8TBR4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STAG3L4Q8TBR4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STAG3L4Q8TBR4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STAG3L4Q8TBR4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STAG3L4Q8TBR4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STAG3L4Q8TBR4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STAG3L4Q8TBR4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
STAG3L4Q8TBR4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STAG3L4Q8TBR4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STAG3L4Q8TBR4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STAG3L4Q8TBR4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STAG3L4Q8TBR4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STAG3L4Q8TBR4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STAG3L4Q8TBR4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STAG3L4Q8TBR4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STAG3L4Q8TBR4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STAG3L4Q8TBR4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STAG3L4Q8TBR4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STAG3L4Q8TBR4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
STAG3L4Q8TBR4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
STAG3L4Q8TBR4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAG3L4Q8TBR4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms