Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO3Q8TAP4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms