Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3C3Q8NEB9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms